La ciudad de Chillán fue fundada el 26 de Julio de 1580 con el nombre de San Bartolomé de Gamboa, por e1 Mariscal Martín Ruiz de Gamboa, Gobernador General de Chile. Fue virtualmente destruida por los indígenas en Marzo de 1655 y por el terremoto de Mayo de 1751. Más tarde se acordó reedificar la ciudad en el sitio que hoy ocupa Chillán Viejo.
Asolada por el terremoto del 20 de Febrero de 1835, Chillán fue reconstruida sobre su actual planta, bajo la presidencia de don Joaquín Pérez. No obstante, el Hospital San Juan de Dios levantado en 1791 en los aledaños de Chillán Viejo, se mantuvo en el lugar que hoy ocupa. La primera noticia acerca del Hospital de Chillán, surge de una Cédula Real del 11 de Diciembre de 1685 dirigida al
Gobernador del Reino y al Obispo de Concepción. En ella se ordena a estas autoridades "que hicieren y dispusiesen se funde y fabrique un hospital en la referida ciudad de San Bartolomé de Chillán". Con anterioridad a esa Cédula, el Consejo de Indias había ordenado que se reservara a los hospitales de Castro y Chillán, el noveno y medio de los diezmos percibidos por sus parroquias. A pesar de las disposiciones de] Consejo de Indias y de
El gran terremoto de 1939 causa importantes daños a los diferentes recintos del hospital y para paliar una situación aflictiva se levantan anexos, pabellones de emergencia en madera.
Entre 194l y 1944 se construye el hospital nuevo de Chillán "Herminda Martín", quedando sólo en los pabellones de emergencia, la central de alimentación, casino y administración, los enfermos crónicos, tuberculosos y el Asilo de Ancianos. Estos últimos servicios fueron trasladados al hospital nuevo en 945. En 952 se creó el Servicio Nacional de Salud, el que toma a su cargo los terrenos, las dependencias abandonadas y la capilla del hospital viejo de San Juan de Dios.
Originalmente, esta capilla y su prolongación de uso hospitalario, se ubicaban sobre un eje central que dividía el hospital San Juan de Dios en dos partes iguales. Un patio rectangular muy alargado, rodeado interiormente de corredores porticados con cielos entablados, acompañaba a ambos lados a este largo cuerpo central. De ambos patios arrancaban, hacia el oriente y hacia el poniente, tres naves perpendiculares separadas por patios en "U". El total de los edificios configuraba una planta general perfectamente simétrica, a la manera del clásico esquema hospitalario renacentista. De este complejo sólo queda el cuerpo central en el que está inserto la capilla, el patio de clausura del poniente y el espacio que media entre el pórtico de la capilla y la calle. En sus características formales exteriores, esta capilla no responde a una arquitectura religiosa tipo. Presenta un volumen rectangular en muros perimetrales de adobes, tan simple como un bodegón, techado a dos grupos con tejas españolas y rodeados en tres de sus lados por un corredor porticado. Su muro posterior que cierra una suerte de ábside, colinda con la prolongación del edificio que forma con la capilla el citado cuerpo central del entonces complejo de San Juan de Dios.
